機器學(xué)習(xí)算法,攻克難疾的新救星
近日,由劍橋大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的研究人員設(shè)計了一種用于藥物發(fā)現(xiàn)的機器學(xué)習(xí)算法,該算法的效率是工業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的兩倍,可以加快開發(fā)新的疾病治療方法的進程。
本文引用地址:http://cafeforensic.com/article/201902/397540.htm
研究人員使用他們的算法來識別新的分子,激活了一種被認(rèn)為與阿爾茨海默病和精神分裂癥相關(guān)的蛋白質(zhì)。
藥物發(fā)現(xiàn)的一個關(guān)鍵問題是預(yù)測一個分子是否會激活特定的生理過程。所以研究人員會構(gòu)建一個統(tǒng)計模型尋找已知的激活過程的分子之間的化學(xué)模式,但是建立這些模型的數(shù)據(jù)是有限的,因為實驗成本很高,并且不清楚哪種化學(xué)模式在統(tǒng)計上是有意義的。
劍橋卡文迪什實驗室的阿爾法·李博士認(rèn)為機器學(xué)習(xí)在計算機視覺等數(shù)據(jù)豐富的領(lǐng)域取得了重大進展,下一個前沿領(lǐng)域就是科學(xué)應(yīng)用,例如藥物發(fā)現(xiàn)。雖然研究人員對這個問題有著物理上的洞察力,但最大的問題是如何將數(shù)據(jù)與基礎(chǔ)化學(xué)和物理學(xué)結(jié)合起來。
該算法由Lee和他的同事與生物制藥公司輝瑞合作開發(fā),利用數(shù)學(xué)將與藥物相關(guān)的化學(xué)模式分離出來。重要的是,該算法研究已知活性分子和已知不活躍的分子,并識別分子中哪些部分對藥物作用很重要,哪些部分不重要。
一種被稱為“數(shù)學(xué)原理”的隨機矩陣?yán)碚摻o出了數(shù)據(jù)集,然后將其與活性和非活性分子的化學(xué)特征的統(tǒng)計數(shù)據(jù)進行比較,得出哪些化學(xué)模式對結(jié)合是重要的,而不是產(chǎn)生于偶然。活性分子還能計算出另外六百萬個分子。研究人員購買并篩選了100個最相關(guān)的分子。由此,他們發(fā)現(xiàn)了四個激活CHRM 1受體的新分子,這是一種可能與阿爾茨海默病和精神分裂癥相關(guān)的蛋白質(zhì)。
從六百萬分子中提取出四個活性分子,就像在干草堆中找到一根針,但是利用機器學(xué)習(xí)算法,事情會變得容易很多。
劍橋大學(xué)的研究人員目前正在開發(fā)算法,來預(yù)測合成復(fù)雜有機分子的方法,以及擴展機器學(xué)習(xí)的新算法。這項研究得到了溫頓可持續(xù)性物理方案的支持。
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