MIT+IBM同時利用AI探索神經(jīng)科學,讓腦科學研究如虎添翼
最近,有兩項分別來自麻省理工學院和IBM的研究,利用人工智能幫助人們進行神經(jīng)科學領域的研究,進一步幫助人們加速對人類大腦的理解。
本文引用地址:http://cafeforensic.com/article/201907/402503.htm一方面,麻省理工學院的研究人員正在訓練機器學習模型,研究從單個分割的大腦掃描圖像和未標記的掃描圖像中,分割大腦解剖結(jié)構(gòu),從而使用人工智能實現(xiàn)神經(jīng)科學圖像分割的自動化。
另一方面,IBM的研究人員創(chuàng)建了一個基于云端的神經(jīng)科學模型,用于研究神經(jīng)退行性疾病(由大腦和脊髓的神經(jīng)元或髓鞘的喪失所致,并隨著時間推移而惡化,導致出現(xiàn)功能障礙),并使用模擬生物進化的算法來解決復雜問題。
一、卷積神經(jīng)網(wǎng)絡為卡牌實時提供信息
在前段時間舉行的模式識別與計算機視覺大會(Conference on Computer Vision and Pattern Recognition)上,來自麻省理工學院的一組研究人員提出了一種創(chuàng)新的人工智能系統(tǒng)。
該系統(tǒng)可以學習從單個分段腦掃描圖像和未標記的掃描圖像中,分割解剖腦結(jié)構(gòu),實現(xiàn)自動化神經(jīng)科學圖像分割。
這種用于神經(jīng)科學的新型人工智能系統(tǒng),是基于一款發(fā)行于1993年的著名集換式卡牌游戲(Collectible card game)《萬智牌(Magic:The Gathering)》而研發(fā)。
Amy Zhao是麻省理工學院電氣工程與計算機科學系(EECS),以及計算機科學與人工智能實驗室(CSAIL)的研究生,同時也是該項研究的第一作者。
最初,她嘗試使用一個由卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(CNN)技術(shù)創(chuàng)建的應用程序,根據(jù)智能手機拍攝的照片,實時為《萬智牌》中的紙牌提供卡牌的類別、屬性和施放費用等詳細信息。
這項技術(shù)的挑戰(zhàn)在于,計算機視覺任務需要一組照片數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集不僅包含20,000張游戲卡牌,而且還包含每張卡牌的不同拍攝外觀和拍攝屬性(如照明)的圖片版本。
但是,手動創(chuàng)建這樣的一個數(shù)據(jù)集需要花費大量的實踐和精力,因此Amy開始通過合成數(shù)據(jù)集中所有卡牌的變形版本,來自動創(chuàng)建數(shù)據(jù)集。
卷積神經(jīng)網(wǎng)絡是一種深度學習算法,具有人工神經(jīng)網(wǎng)絡結(jié)構(gòu),該算法受生物大腦視覺皮層的啟發(fā),用一小部分數(shù)據(jù)進行訓練。
Amy使用200張卡牌,每張卡牌分別搭配10張照片,讓卷積神經(jīng)網(wǎng)絡經(jīng)過訓練,學習如何判斷卡牌的所處的不同位置和照片外觀,如亮度、反射和照片角度,從而能夠合成數(shù)據(jù)集內(nèi)所有卡牌的真實變形版本組。
二、卷積神經(jīng)網(wǎng)絡分析腦圖像的過程
Amy發(fā)現(xiàn),這種變形的方法可以應用于磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,簡稱MRI)中。磁共振成像是斷層成像的一種,能夠利用磁共振現(xiàn)象從人體中獲得電磁信號,并重建出人體信息。
人工智能深度學習的模式識別功能是機器學習的一個子集,它幫助神經(jīng)科學家對腦圖像進行復雜的分析。然而,訓練該機器學習算法是一個昂貴的、勞動密集型的挑戰(zhàn)。
一方面,對于神經(jīng)科學研究,訓練機器學習通常需要神經(jīng)科學家在每一次的腦部掃描中,手動對解剖結(jié)構(gòu)進行數(shù)據(jù)標記。
另一方面,圖像分割是基于共享特征對圖像像素進行標記的過程,而磁共振成像的圖像又是一個以三維像素形式呈現(xiàn)的體素。
因此,神經(jīng)科學的研究人員經(jīng)常需要根據(jù)大腦的解剖結(jié)構(gòu),對體素區(qū)域進行分離和標記,手工進行圖像分割。
Amy與麻省理工學院博士后助理Guha Balakrishnan、Frédo Durand教授、John V. Guttag教授,以及資深作家Adrian V. Dalca,使用單一標記的分段腦MRI掃描和一組100個未標記的病人掃描,完成了自動化神經(jīng)科學圖像分割過程。
在研究過程中,研究人員使用了兩個卷積神經(jīng)網(wǎng)絡。
首先,卷積神經(jīng)網(wǎng)絡從100個未標記的掃描中學習亮度、對比度、噪聲和空間變換流場(指運動流體所占的空間區(qū)域里的速度、壓強等因素)的變化,這些變化模擬了掃描之間的體素運動。
其次,為了合成新的標記掃描,系統(tǒng)生成一個隨機的流場,并將這個隨機的流場應用于標記的MRI掃描,以匹配未標記掃描數(shù)據(jù)集中實際患者的MRI。然后,系統(tǒng)將所學習到的亮度、對比度和噪聲變化進行隨機組合。
最后,系統(tǒng)根據(jù)提速運動的流場,將標簽標記到合成掃描的圖像中。這些合成的掃描圖像將被輸入到一個單獨的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡,以便訓練該卷積神經(jīng)網(wǎng)絡學習如何分割新的圖像。
三、該框架可合成逼真多樣的標記實例
此外,研究小組對30種大腦結(jié)構(gòu)的圖像分割系統(tǒng)進行了100次掃描,并將其與現(xiàn)有的自動和手動分割方法進行了比較。結(jié)果表明,該方法與現(xiàn)有的圖像分割方法相比有了顯著改進,特別是在海馬體等較小的大腦結(jié)構(gòu)方面。
研究人員在論文中表示,在他們的測試集中,分割器在每個例子上都比現(xiàn)有的單次分割方法做得更好,接近完全監(jiān)督模型的性能(之前大多是半監(jiān)督的)。該機器學習框架可在多個醫(yī)學領域應用,比如臨床設置,在臨床設置中由于時間限制,通常只允許手工注釋少量掃描。
對此,麻省理工學院的研究人員表明,通過機器學習從未標記的大腦掃描圖像中,獨立的空間和外觀轉(zhuǎn)換模型,可以合成逼真多樣的標記實例。
另外,系統(tǒng)生成的合成示例可以用來訓練性能等于甚至優(yōu)于當前圖像分割方法的分割模型,這也是為什么《萬智牌》能催生一種可訓練人工智能深度學習算法的新方法。
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